広告の掲載位置
AdSense では、数多くの広告フォーマットと広告商品を用意しています。 下記のポリシーに従い、さまざまな掲載位置をテストされることをお勧めします。
広告ユニットは各ページに 3 つまで表示できます。
Google AdSense の検索ボックスは各ページに 2 つまで表示できます。
リンクユニットは各ページに 3 つまで表示できます。
上記の広告ユニット、検索ボックス、リンクユニットに加え、紹介ユニットは各ページに 3 つまで表示できます。
検索向け AdSense の検索結果ページには、Google の検索結果に表示される広告に加え、広告リンクユニットを 1 つだけ表示できます。 その他の広告を検索結果ページに表示することはできません。
Google 広告または Google 検索ボックスをポップアップ、ポップアンダー、またはメールに表示することはできません。
ページに広告の一部を隠す要素を表示することは許可されていません。
コンテンツを含まないページに Google 広告を表示することはできません。
広告の掲載を唯一の目的としたウェブ ページには、ページのコンテンツの関連性にかかわりなく、
Google 広告を表示することはできません。

となっています。
adsence公告が「ページが見つかりません」と表示され
もし、該当するような場合は出来るだけ速やかに削除しましょう。

ブログ記事の本文と続きの間に紹介の336x280のスクウェア

「ブログ記事の詳細」にスクエアを以下のように埋め込む方法

<MTIfNonEmpty tag="EntryMore" convert_breaks="0">
<div id="more" class="asset-more">

<script type="text/javascript"><!--
google_ad_client = "pub-＊＊＊＊＊";
/* 336x280, 作成済み 08/05/21 */
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google_ad_width = 336;
google_ad_height = 280;
//-->
</script>
<script type="text/javascript"
src="http://pagead2.googlesyndication.com/pagead/show_ads.js">
</script>

<$MTEntryMore$>
</div>
</MTIfNonEmpty>

私の場合はテンプレートモジュールを作成して埋め込んでいます。

<$MTInclude module="（モジュールテンプレート名）"$>

1ページ内の広告の数などにも影響するので、

注意しながら貼り付けましょう。

「ヘッダー」の中にビッグバナーを以下のように埋め込む。

テンプレートモジュールから「ヘッダー」を選択する。

</MTIf>
</div>
</div>
</div>

<script type="text/javascript"><!--
google_ad_client = "pub-***********";
/* 728x90, 作成済み 08/05/21 */
google_ad_slot = "0549797480";
google_ad_width = 728;
google_ad_height = 90;
//-->
</script>
<script type="text/javascript"
src="http://pagead2.googlesyndication.com/pagead/show_ads.js">
</script>

<div id="content">
<div id="content-inner">
<div id="alpha">
<div id="alpha-inner">

これでヘッダーの部分に広告が表示されるはずです。

adsenseを表示したい部分に、

<$MTInclude module="（モジュールテンプレート名）"$>

で貼り付ける方法があります。